На сегодня это последняя, актуальная версия ( Yandex Metro - схема метро и расчёт времени в пути 3.6.9), свежее просто не бывает.
Для того, что бы скачать и уставновить актуальную версию приложения Яндекс Метро на свое андройд устройство, вам необходимо в настройках разрешить установку из неизвестных истоников.